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JMD重磅!大样本临床研究证实肿瘤组织起源基因检测的有效

作者:华体会 时间:2021-09-11 00:13
本文摘要:该项研究纳入了已明确原发灶的323例原发性肿瘤和286例转移性肿瘤的石蜡包埋组织(FFPE)样本接纳Canhelp-Origin Assay对样本的组织起源举行判断并与金尺度病理诊断效果举行比力。研究显示Canhelp-Origin Assay在原发性肿瘤和转移性肿瘤中的判读准确率划分为90.4%和89.2%。对于病理诊断难题的低分化、未分化肿瘤和鳞状细胞癌Canhelp-Origin Assay也体现出优异的性能判断准确率划分到达90.0%和84.4%。

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该项研究纳入了已明确原发灶的323例原发性肿瘤和286例转移性肿瘤的石蜡包埋组织(FFPE)样本接纳Canhelp-Origin Assay对样本的组织起源举行判断并与金尺度病理诊断效果举行比力。研究显示Canhelp-Origin Assay在原发性肿瘤和转移性肿瘤中的判读准确率划分为90.4%和89.2%。对于病理诊断难题的低分化、未分化肿瘤和鳞状细胞癌Canhelp-Origin Assay也体现出优异的性能判断准确率划分到达90.0%和84.4%。

研究进一步验证了Canhelp-Origin Assay用于CUP患者辅助诊断的有效性与临床意义。研究共纳入了真实世界中141例原发灶不明恶性肿瘤患者。

临床数据显示CUP患者最常见的转移部位为淋逢迎(45.4%)、肝脏(12.8%)和肺部(11.4%)。病理学上CUP患者中低分化、未分化肿瘤和鳞状细胞癌的比例较高划分为50.4%和24.1%。接纳Canhelp-Origin Assay辅助诊断肿瘤的组织起源凌驾80%患者(116例82.3%)的诊断效果能够为临床接纳有针对性的治疗提供支持。

针对这一临床问题构建了笼罩21种实体肿瘤、数万例样本的泛肿瘤基因表达谱数据库(Canhelp-PanCA%uAE Database)。通过生物信息学和人工智能算法对差别癌症的基因表达谱举行分析从中筛选出与21种肿瘤类型显著相关的90个特征基因并基于荧光定量PCR平台(qPCR)建设肿瘤组织起源基因检测(Canhelp-Origin%uAE Assay)。

复旦大学隶属肿瘤医院病理科周晓燕教授开展了Canhelp-Origin Assay在海内的大样本量临床研究[4]。研究结果近期揭晓在分子病理权威期刊The Journal of Molecular Diagnostics。

原发灶不明恶性肿瘤(Carcinomas of Unknown PrimaryCUP)是一类确诊为转移性但经由详尽的检测和评估仍然不能确定原发灶的恶性肿瘤。在世界规模内CUP 约莫占所有新发癌症的3%~5%是全球第八大最常见的癌症也是死亡率第四高的癌症。现在对于CUP患者尚无尺度的治疗方法一般接纳广谱的化疗方案(如紫杉醇、卡铂等)可是疗效不佳预后较差中位生存期不到12个月5年生存期仅为14%。若能通过多样化的检查方案确定其原发灶凭据其原发灶举行针对性的治疗则患者的预后情况将获得改善。

研究简介

JMD重磅!大样本临床研究证实肿瘤组织起源基因检测的有效

研究还系统评估了差别组织和器官起源的33例脑转移及35例肝转移肿瘤样本判读准确率划分为81.8%和91.5%。针对一些判别诊断难题的肿瘤类型如泉源于胰腺、肺、肉瘤、结直肠、乳腺等差别部位的粘液性肿瘤Canhelp-Origin Assay准确判断所有粘液性肿瘤的原发部位准确率到达100%;而且在一些肿瘤如胃肝样腺癌、肉瘤样间皮瘤中同样也具有良好的分析性能。

Canhelp-Origin%uAE Assay 开发流程

The Journal of Molecular Diagnostics 《分子诊断学杂志》是美国分子病理学协会(AMP)的官方刊物。

杂志旨在揭晓高质量的原创论文内容涉及新型分子标志物的发现与临床应用、分子诊断领域的技术生长重点关注分子诊断方法在通例临床诊断中的大规模验证。期刊已公布诸多分子诊断领域的行业指南如由美国分子病理学协会(AMP)和美国病理学家学会(CAP)团结制定的《NGS生物信息流程验证尺度和指南》和《NGS肿瘤检测流程验证指南》为分子诊断技术应用于临床提供了统一的尺度和规范。

“确定CUP患者的原发灶对于患者的治疗选择至关重要本研究乐成实现了肿瘤组织起源表达谱型分子标志物在 qPCR技术平台上的转化应用基于PCR平台的Canhelp-Origin Assay适用于FFPE样本其简朴的操作和开放的平台可广泛应用于分子病理实验室。”主要研究者周晓燕教授指出“大样本量临床研究效果显示Canhelp-Origin Assay对于判别肿瘤的组织起源具有较好的性能展现出其在中国CUP患者病理诊断和临床治疗中的潜在价值提示其有望成为CUP患者诊断的重要辅助工具为实现CUP的精准治疗提供支持。”

参考文献

4Ye Q, Wang QF et al. Development and Clinical Validation of a 90-Gene Expression Assay for Identifying Tumor Tissue Origin. The Journal of Molecular Diagnostics.

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